<Directory "/home/hoge/www/example">
# WordPress用にFollowSymLinksとAllowOverrideを有効にする
Options FollowSymLinks
AllowOverride All
Order Allow,Deny
Allow from all
# .phpをPHPとしてパースする
<FilesMatch "\.php$">
SetHandler application/x-httpd-php
</FilesMatch>
# WordPressパーマリンク設定
<IfModule mod_rewrite.c>
RewriteEngine On
RewriteBase /
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-f
RewriteCond %{REQUEST_FILENAME} !-d
RewriteRule . /index.php [L]
</IfModule>
</Directory>
っていうように.htaccessに書かれる内容をDirectoryタグでくくればOKだった。